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选择开放样本来管理ARTB的生物样本库

奥克兰地区组织银行(ARTB)是新西兰医学研究基础设施的重要组成部分。作为存储血液和组织样本的中心设施,他们有一个图书馆,可以藏有一些秘密,可以为现有和未来的慢性病和疾病解锁治疗方法。他们将这些样本提供给奥克兰大学以及整个新西兰的研究人员以及更远地区的合作者。

收集用于医学研究的样本非常必要,因为它充当研究人员可以随时访问的存储库。ARTB目前可容纳约125,000个样本,并且在过去四年中呈指数增长。如果没有ARTB这样的机构,收集样本将是一项繁琐而繁琐的任务,需要大量的研究人员时间并减慢医学研究的速度。但是,拥有样本只是方程式的一部分。能够获取具有特定临床参数的正确样本以分离特定菌株,遗传性状或组织类型同样重要。

区域组织银行经理Phillip Shepherd说:

当奥克兰大学创建ARTB并从Middlemore医院组织库中获取现有样本库时,有必要统一生物信息学系统,我们正在寻找一种能够以建设性方式管理我们的生物库的健壮结构化系统。我们选择了Openspecimen,因为该系统能够根据我们的特定需求进行定制,而开发人员Krishagni致力于生物银行业务,并拥有丰富的经验,可供我们借鉴。”

开放式标本最初由美国国家癌症研究所(NCI)资助开发,用于汇总和管理生物标本数据,现已继续发展成为一个全面的开源生物信息学平台。现在,它已在全球65个以上的生物库中使用。

ARTB从一开始就与Krishagni进行了接触。通过让他们参与他们的工作流程和实践,Krishagni可以更轻松地为Openspecimen提供建议和个性化要求。

Openspecimen的开放源代码性质使我们可以自己对系统进行更改,而不必被锁定在需要进行任何更改的开发人员手中。当然,我们要让Krishagni参与其中的修改,并且它们总是非常适应和响应。

ARTB的Openspecimen超级用户和Tissuebank技术员Alice Rykers谈到她在Openspecimen方面的经验时说:“我真的很喜欢使用它,并且对它的工作方式印象深刻。它为我们提供了出色的可视性,查询模块是它的天赐之物,它具有快速生成报告和显示数据的能力。”

尽管ARTB的组织样本收集策略性地集中于血液癌,心脏病,乳腺癌,肉瘤,黑素瘤和子宫内膜异位等医学研究领域,但它们始终愿意与其他研究小组合作,以提供服务。毫无疑问,这将使他们有价值的图书馆继续增长,从而提高ARTB的实用性。有了Openspecimen将能够与之一起成长的知识,这一切都可能发生。

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