您现在的位置是:首页 >新闻频道行业观察 2019-12-03 10:52:38

微生物群在维持地球和我们身体健康的自然过程中起着至关重要的作用

微生物群在维持地球和我们身体健康的自然过程中起着至关重要的作用,因此,科学家对这些多样的微生物群落的研究正在推动医学,可持续农业,廉价的水净化方法和环境净化技术的进步,这不足为奇,仅举几个。但是,试图确定哪些微生物有助于重要的地球化学或生理反应既困难又艰巨,因为该任务涉及分析大量遗传和代谢信息数据集,以将介导过程的化合物与产生它们的微生物进行匹配。

但是现在,研究人员已经设计出一种新方法来解决信息超载问题。

加州大学圣地亚哥分校领导的一个团队在《自然方法》一书中描述了一种基于神经网络的方法,称为微生物代谢载体(mmvec),该方法使用概率来确定共生微生物和代谢物之间最可能的关系。该团队通过将mmvec应用于来自两种经过深入研究的微生物群落类型(在沙漠土壤和囊性纤维化患者的肺部中发现的微生物群)的数据集,演示了mmvec如何优于传统的基于相关性的方法,并介绍了该方法如何在实验室中使用。通过揭示微生物产生的代谢产物与炎症性肠病之间的关系来实现未来。

博士后研究员,来自伯克利实验室(Berkeley Lab)的三位研究作者之一,马克·范·戈瑟姆(Marc Van Goethem)说:“以前的统计工具用来估计微生物与代谢物的相关性与随机机会相当。“它们的不良性能导致发现了虚假关系,并错过了许多真实关系。Mmvec是一种功能强大的新工具,可以准确地将代谢物和微生物丰度联系起来,以解决此问题。从临床试验到环境工程,可能会有广泛的应用。最终,mmvec将使我们开始从简单的模式识别转向解构机制。”

郑重声明:本文版权归原作者所有,转载文章仅为传播更多信息之目的,如作者信息标记有误,请第一时间联系我们修改或删除,多谢。

相关文章