您现在的位置是:首页 >新闻频道企业要闻 2019-10-31 10:54:43

小组追踪可能致命的谷热的起源和传播

转化基因组学研究所(TGen)的科学家利用最新的基因组分析技术,追踪了引起谷热的真菌的可能起源和扩散,该研究今天发表在mBio杂志上,该杂志报道了高发影响微生物学研究。

在一个长达200万年的故事中,包括冰川作用和动物寄主的史前运动,该研究为跟踪这种潜在致命的尘土飞扬的疾病在北部和北部干旱地区的爆发奠定了基础。南美洲。

谷热是由微小真菌球虫引起的感染,该球菌生活在沙漠土壤中,通常通过肺部进入人体。每年估计有150,000美国人被Valley Fever感染,每年有500例死亡。

TGen病原基因组学部或TGen North的程序和运营总监David Engelthaler博士说:“将全基因组测序和先进的统计分析结合起来,可以了解这种真菌的可能祖先和传播途径。”主要作者。“古流行病学的这种应用使我们不仅能够了解何时在西半球散布着谷热菌,而且还了解了如何。”

北亚利桑那大学微生物中心主任TGen North主任Paul Keim博士说:“这些数据和分析提高了我们今天进行基因组流行病学的能力,并使我们对这种疾病的不断变化的分布有了更好的了解。”遗传学与基因组学,该研究的资深作者之一。

接近60%的感染者以及其他哺乳动物,尤其是狗,由于接触谷热而没有明显症状。

但是,一些受感染的患者会出现严重的虚弱症状,例如咳嗽,发烧和疲劳。这些症状类似于由细菌或病毒引起的其他呼吸系统疾病,通常会导致诊断延迟和治疗不当。非常严重的谷热可能需要终生使用抗真菌药物治疗,甚至死亡。

山谷热在索诺兰沙漠演变

引起谷热的真菌球虫有两种不同的物种:C. posadasii,最古老的物种,起源于亚利桑那州南部的索诺兰沙漠和墨西哥北部。和C.丝虫,这是在加州中央谷地,以及南加州和墨西哥的巴哈的地区发现的物种。

利用来自86个球虫基因组的遗传数据,该研究的分析估计,波氏梭菌在82万至200万年前之间分化,形成了亚利桑那和非亚利桑那亚种群。

今天的亚利桑那亚型遍布整个亚利桑那中部和南部。在亚利桑那州,TGen的研究人员确定了来自图森地区的多个不同的遗传群体,其中一个也包括所有的凤凰分离株,其中谷热的浓度最高。

该研究的作者还估计,这种真菌传播到墨西哥和得克萨斯州多达675,000年前,传播到南美大约52.7万年前,而传播到中美洲的危地马拉不到190,000年前。

C.丝虫似乎已经从亚利桑那州的分歧C. posadasii种类年365000和92万年前之间在加州中部的圣华金河谷。在更新世时期(直到260万年前),这是内陆海域。早在700,000年前,它就被冰川径流淹没,而引水梭状芽胞杆菌的出现很可能是在引流之后。内华达山脉山脉形成的屏障也可能在C. immitis的形成中起了独立的作用。

谷热正在蔓延到新的领域

真菌的地理范围正在扩大。在华盛顿州东部,已经发现了新的C. immitis簇,很可能是从加利福尼亚出现的。谷热也发生在阿根廷,巴拉圭,巴西和洪都拉斯。该病原体先前的传播很大程度上归因于过去几十万年中的主要动物迁徙。除人类外,高度易感的哺乳动物还包括狗和其他犬科动物,啮齿动物,以及在南美的美洲驼,犰狳和蝙蝠。最近扩展到华盛顿的原因仍然不确定。

TGen助理教授兼TGen北亚利桑那谷热研究中心负责人Bridget Barker博士说:“这种扩展的遗传机制和流行病学后果尚不清楚,需要更好地了解这些病原体的种群结构和进化史。”该研究的另一位作者。Barker博士还领导TGen研究被真菌感染的狗(称为Valley Fever PAWS)。

该研究的结论是,这些发现证明了对球虫的进一步大规模种群测序,尤其是从代表性不足的地区,尤其是从索诺拉和墨西哥北部其他地区的球虫,尤其是从环境中分离的菌株。

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