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新的数据库有助于确定与传染病作斗争的治疗目标

传染病是由能够进入,定植和在宿主生物体内生长的病原微生物引起的,从而产生感染。近年来,细菌感染在全球范围内呈上升趋势,但细菌致病机理的许多机制仍知之甚少。考虑到以下事实,这是高度相关的,因为新的抗微生物疗法的发展很大程度上是基于对这些感染背后机制的最新了解。由细菌基因编码的蛋白质负责成千上万的生化过程,这些过程对于病原体的有效繁殖至关重要。

但是,许多研究表明,为了鉴定这些基因,需要有关感染宿主真实病例中细菌发生情况的体内信息。体外研究,即在实验室中用细胞和细菌培养物进行重建的研究,后来并不总是与体内研究的数据相关。这是由于以下事实:产生感染所必需的病原细菌基因取决于所定植生物体的环境。

巴塞罗那自治大学生物化学和分子生物学系以及基因组调控中心(CRG)的一组研究人员创建了BacFITBase数据库。根据体内实验的结果,研究人员系统地表征了与宿主细胞入侵和感染有关的细菌基因。进行的所有实验均基于一种名为转座子诱变的技术,该技术将称为转座子的DNA片段转移至生物体的致病基因,从而使其失活。

这样,就可以直接观察到它们在感染中的作用,研究人员可以确定对于特定宿主生物感染哪些是必需的。因此,该数据库将使鉴定目标蛋白变得更加容易,这些目标蛋白可帮助抵抗传染病并加速新型抗菌剂的开发。

该数据库包含90,000多个条目,其中包含有关特定致病细菌基因及其在五个不同宿主物种中对体内感染状况的贡献的信息。它包括总共15种细菌的两种变型的信息(肠沙门氏菌,流感嗜血杆菌,化脓性链球菌,牙龈卟啉,鸟分枝杆菌,的三种变体大肠杆菌,霍乱弧菌,空肠弯曲杆菌,肺炎克雷伯菌,鲍曼不动杆菌,粘质沙雷氏菌和弧菌副溶血性)和5个模型脊椎动物(牛,猪,母鸡,小鼠和兔子),并提供10种不同组织的信息。

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